南山经主要介绍南方三大山系的地貌矿藏和怪兽珍禽，以及各大山系的山神祭祀情况。三大山系共辖有大小四十座山脉，总长度有一万六千三百八十里。
第一山系—招摇山。它耸立于西海岸边，山上长着许多桂树，蕴藏着丰富的金、玉矿石。招摇山上有吃了不会饥饿的神草祝余；枢阳山上有会吟唱的怪兽鹿蜀；柢山上有长着翅膀的鯥鱼，吃了它可以防治疾病；青丘山上有叫灌灌的鸟，人们佩戴它可以不受蛊惑。
在第二山系，向东三百四十里，是尧光山，有食人的猛兽猾褢和蛊雕。
在第三山系，丹穴山和南禹山上有德鸟凤凰，它一出现就意味着天下将会太平；仑者山上有神木白?，人吃了它不会饥饿，还可以解除疲劳。